Зав’язка. У руїнах старого амфітеатру оселяється Момо. Місцеві мешканці допомагають їй, а вона натомість допомагає їм просто тим, що слухає. Світ довкола неї сповнений тепла: діти грають у піратів, дорослі вирішують застарілі конфлікти. У цей ідилічний світ непомітно проникають Сірі пани, які починають «обробляти» городян, пропонуючи їм заощаджувати час.

Розвиток дії. Місто змінюється до невпізнаваності: люди стають успішними, але вічно похмурими й заклопотаними. У них немає часу на розмови, дружбу чи навіть їжу. До Момо приходить агент № XYQ/384/b. Намагаючись підкупити її механічною лялькою, він через щирість дівчинки випадково виказує таємницю: Сірі пани живуть за рахунок вкраденого часу. Дівчинка розуміє, що її друзів пограбовано, і вирішує діяти.

Кульмінація. Майстер Гора пояснює Момо, що час — це «квітки-години», які розквітають у серці. Щоб знищити крадіїв, Майстер Гора засинає, зупиняючи час у всьому світі. У Момо є лише одна квітка-година і рівно одна година реального часу, щоб пробратися до підземного сховища Сірих панів у застиглому місті. Вона повинна закрити доступ до «складу» часу, поки пани не викурили всі свої сигари.

Розв’язка. Момо вдається зачинити двері сейфа, де зберігається вкрадений час. Позбавлені диму сигар, Сірі пани розчиняються в повітрі. Вкрадений час у вигляді пелюсток квіток-годин повертається до своїх власників. Світ «прокидається», люди знову стають усміхненими, а Беппо та Джіджі повертаються до справжнього життя поруч із дівчинкою.